İnsan genomunun karanlık madde gizemi

Onzen, proteinleri yaşam makinelerinin bileşenleri olarak düşünmeyi sevdiğini, karanlık genomun ise dış bilgileri işleyen ve bunlara yanıt veren bir yazılım olduğunu söylüyor. Sonuç olarak, karanlık genom hakkında ne kadar çok şey bilirsek, insanın karmaşıklığını ve nasıl olduğumuz kişi olduğumuzu o kadar iyi anlarız.

Onzen, “Bizi bir tür olarak düşünürseniz, çevreye her düzeyde uyum sağlama konusunda oldukça iyiyiz” diyor. “Ve bu adaptasyon bilgi işlemedir. Bizi bir sinek veya solucandan farklı kılanın ne olduğu sorusuna geri döndüğünüzde, cevapların karanlık genomda yattığını giderek daha fazla anladık.”

Transpozonlar ve evrimsel geçmişimiz

Bilim adamları 2000’li yılların ortalarında Hayat Kitabı’nı ilk kez incelemeye başladıklarında, en büyük zorluklardan biri, insan genomunun protein kodlamayan bölgelerinin tekrarlayan DNA dizileriyle dolu görünmesiydi. transpozonlar. Bu tekrarlayan diziler o kadar yaygın ki, genomun yaklaşık yarısı yaşayan tüm memelilerde.

New York City’deki bir akademik tıp merkezi olan NYU Langone’de Karanlık Madde Projesi’ni yöneten Jef Boeke, “Bu tekrarlayan dizilerin varlığı nedeniyle ilk insan genomunun bir araya getirilmesi bile daha sorunlu hale geldi” diyor. “Benzersiz bir diziyse, herhangi bir diziyi ayrıştırmak çok daha kolay.”

İlk başta, genetikçiler transpozonları görmezden geldiler. Çoğu genetik çalışma, yalnızca genomun küçük protein kodlayan bölgesi olan ekzoma odaklanmayı seçer. Ancak son on yılda, daha gelişmiş DNA dizileme teknolojilerinin ortaya çıkışı, genetikçilerin karanlık genomu her zamankinden daha ayrıntılı bir şekilde incelemesine olanak sağladı. bir deneyimAraştırmacıların farelerdeki transpozonların belirli bir bölümünü sildiği ve hayvanın yavrularının yarısının doğumdan önce ölmesine neden olduğu bu çalışma, bazı transpozon dizilerinin hayatta kalmamız için kritik olabileceğini gösterdi.

Bock, genomlarımızdaki transpozonların varlığının belki de en iyi açıklamasının, bunların son derece eski olmaları, yaşamın en eski biçimlerine kadar gitmeleri olduğunu söylüyor. Diğer bilim adamları, bazı yararlı amaçlara hizmet etmek için vücutta kademeli olarak yeniden tasarlanmadan önce, insanlık tarihi boyunca DNA’mızı işgal eden virüslerden geldiğini öne sürdüler.

UCLA’da hücre biyolojisi profesörü yardımcısı Dirk Hokyer, “Çoğu zaman, transpozonlar bizi enfekte eden patojenlerdir ve gelecek nesillere aktardığımız hücre türü olan germ hattındaki hücreleri enfekte edebilirler” diyor. Berkeley. “O zaman kalıtsal olabilir ve genomda kararlı füzyonlara yol açabilir.”