DNA bazları havuzda keşfedilen küçük bir organizma tarafından ‘yeniden yazıldı’

DNA’nın kurallarının katı olduğunu düşünebiliriz ancak İngiltere’nin Oxford kentinde bir bahçe havuzunda bulunan mikroskobik bir organizmanın genetik kodu, bilimin sürekli değiştiğini bir kez daha kanıtladı.

Dr Jamie McGowan ile Earlham Enstitüsü ve Oxford Üniversitesi’nden bir araştırmacı ekibi, başlangıçta tek hücreli organizmalarda bulunanlar gibi çok küçük miktarlarda DNA’nın dizilimini yapmanın yeni bir yolu üzerinde çalıştığından, bu keşif tamamen beklenmedik bir gelişmeydi.

Yöntemlerini test edecek bir şey arayan ekip, Oxford Üniversitesi’nin bahçesindeki tatlı su birikintisinden bir protist izole etti. Dünya’da hangi protistlerin olduğunu merak ediyorsanız, McGowan’ın yararlı bir açıklaması var (ya da nasıl baktığınıza bağlı olarak değil):

McGowan makalesinde şöyle dedi: “Protist tanımı gevşek; temel olarak hayvan, bitki veya mantar olmayan herhangi bir ökaryotik organizmadır.” ifade. “Bu açıkça çok genel çünkü protistler çok değişken bir grup.

“Bazıları hayvanlarla, bazıları ise bitkilerle yakın akrabadır. Avcılar ve avlar, parazitler ve konakçılar, yüzücüler ve oturanlar var, çeşitli beslenenler var, bazıları ise fotosentez yapıyor. Temelde çok az genelleme yapabiliriz. ”

Protistlerin genomunu analiz eden McGowan, bunun yalnızca tamamen yeni bir tür olmadığını keşfetti; Himenofori sp. PL0344, ama aynı zamanda genetik kodunda da benzersiz bir farklılığa sahipti.

Bizi okula geri götürüyor

Okulda DNA’nın kopyalanıp proteinlere dönüştürülmesini öğrenmiş olabilirsiniz, ancak bu konuda çok az bilginiz var. Bilgi tazelemek için ile Teknoloji ağları O asla yanılmaz.

DNA bir tarif gibidir. Transkripsiyon biraz o tarifi okuyup onu bazı değişikliklerle kopyalamaya benziyor – transkripsiyon RNA’dır, burada T yerine U vardır. Cümlenin sonunda bir nokta buluyoruz ve bunun DNA kopyası da durak. genin nerede bittiğini bize söyleyen üç harfli bir dizi olan kodon. RNA, proteinin yapı taşları olan amino asitlere çevrildiğinde, bir durdurma kodonu, proteinin küçük aşçılarına (ribozomlar olarak da bilinir) nerede duracaklarını söyler.

Durdurma kodonları TAA, TAG ve TGA neredeyse tüm organizmalarda bulunur ve özellikle birinci ve ikinci kodonların güçlü bir şekilde bağlantılı olduğu düşünülmektedir, çünkü biri değişmeden diğeri de değişmemektedir.

McGowan, “Bildiğimiz hemen hemen her durumda, TAA ve TAG birlikte değişiyor” dedi. “Durdurma kodonları olmadıklarında, her biri aynı amino asidi belirtir.”

Yeni genetik keşif

Himenofori sp. Bununla birlikte, PL0344 bu eğilime karşı çıkıyor: Bu, genellikle DNA’sında değişiklikler olan, suda yaşayan bir tür protist olan siliattır. Genomunda yalnızca TGA bir durdurma kodonunu kodlar ve doğal ikiz TAA ve TAG, iki farklı amino asite çevrilir. Ayrıca protistlerin genomunda beklenenden daha fazla TGA kopyası var ve araştırmacılar bunun diğer iki durdurma kodonunun eksikliğini telafi ettiğine inanıyor.

McGowan, “Bu çok alışılmadık bir durum” diye açıkladı. “Bu durdurma kodonlarının iki farklı amino asitle bağlantılı olduğu başka bir durumun farkında değiliz. Bu, gen çevirisi hakkında bildiğimizi düşündüğümüz bazı kuralları çiğniyor, çünkü bu iki kodonun birbiriyle ilişkili olduğu düşünülüyordu.”

Araştırmacıların bulduğu anormallik türleri Himenofori sp. PL0344 gelecekteki genetik keşifler için ilham kaynağı olabilir.

“Bilim insanları yeni genetik kodlar oluşturmaya çalışıyor ama bunlar doğada da var. Eğer ararsak bulabileceğimiz harika şeyler var.”

“Ya da bu durumda,” dedi McGowan, “onları aramadığımız zaman.”

Çalışma şurada yayınlandı: PLOS Genetiği.